经常做分子实验的同砚都知道，，核酸染料可以和核酸分子（DNA、RNA，，本文以DNA为例）相连系，，在引发光的照射下发出荧光。。。核酸电泳就是使用这个原理通过核酸染料来指示DNA片断的巨细和大致的浓度。。。

差别的核酸染料的分子结构差别，，与DNA连系的方法也差别，，若是在电泳前连系的话会对电泳爆发差别水平的影响。。。这一期，，小编就为各人厘清差别染料之间的区别。。。

下图是威尼斯国际2299cc生物的Marker1用两种差别的染料染色后（胶染法，，即制胶时加入染料，，预染法的一种）的电泳图

从上图可以看出染料的用量和染料的种类都会影响DNA条带的形状和疏散情形。。。

关于核酸染料对电泳的影响已经引起了许多科研职员的重视，，如2018年的一篇文章《核酸染料GeneGreen可影响DNA琼脂糖凝胶电泳条带的质量》叙述了一种新型核酸染料对DNA电泳的影响远大于古板核酸染料溴化乙锭（EB）。。。


该文主要验证了胶染法和后染法（电泳后置于染液中染色）对DNA条带的差别影响，，主要实验内容如下：


效果：在含１×ＧｅｎｅＧｒｅｅｎ的琼脂糖凝胶中，，３种ＤＮＡ Ｍａｒｋｅｒ的较大条带均不但一，，呈“拖尾”征象；；；而最小的Ｍａｒｋｅｒ条带简单，，无扭曲和拖尾”（图１Ａ）。。。在含１×溴化乙锭的琼脂糖凝胶中，，３种ＤＮＡ Ｍａｒｋｅｒ的条带均泛起简单的条带（图１Ｂ）。。。


效果：在含２×ＧｅｎｅＧｒｅｅｎ的琼脂糖凝胶中，，３种ＤＮＡ Ｍａｒｋｅｒ较大相对分子质量的条带均不但一，，而较小相对分子质量的条带无扭曲和“拖尾”，，但总体质量较１×核酸染料的凝胶好；；；而在２×溴化乙锭的琼脂糖凝胶中，，３种ＤＮＡ  Ｍａｒｋｅｒ的条带均泛起简单的条带，，与１×溴化乙锭的琼脂糖凝胶中的条带质量无显着差别（图２）。。。


效果：接纳核酸电泳后琼脂糖凝胶染色的方法，，１×ＧｅｎｅＧｒｅｅｎ（图３Ａ）和１×溴化乙锭（图３Ｂ）两种核酸染料的琼脂糖凝胶中均可以见条带简单、无扭曲的ＤＮＡ条带。。。（图中后染法的染色效果不太好，，但着实后染法也可以把条带染得很清晰。。。）

除了GeneGreen外，，其他新型核酸染料如GelRed、GelGreen、以及SYBR系列等染料均会影响DNA的迁徙。。。

缘故原由在于核酸染料通过静电作用连系DNA后改变了DNA的空间结构，，DNA携带的负电荷镌汰，，分子量增大，，使DNA分子在琼脂糖凝胶中的相互作用力爆发了改变。。。其运动特点就与未连系染料的DNA分子差别了。。。

EB连系DNA的方法是直接嵌入碱基对之间，，对DNA的空间结构影响不大，，因此对DNA的迁徙影响也不大。。。

出于清静思量，，新型核酸染料的分子结构都大于EB，，以使其不可穿透细胞膜进入人体细胞。。。

这些新型染料与较短ＤＮＡ分子连系后，，电泳历程中不会泛起ＤＮＡ条带扭曲或“拖尾”征象；；；而在与较长ＤＮＡ分子连系后，，能够影响ＤＮＡ条带的形态。。。

现在我们明确了染料对核酸电泳的影响，，关于怎样阻止新型染料的这种滋扰，，有以下建议：

1. 接纳后染法举行染色

2. 选择质量好、滋扰小的核酸染料

3. 选用与染料配套的DNA Marker

由于差别厂家的DNA Marker生产工艺差别，，与差别核酸染料的搭配效果也可能差别。。。在使用威尼斯国际2299ccDNA Marker时若是泛起了条带异常的征象，，请实时向我们反响。。。手艺支持邮箱technique@dongshengbio.com。。。

各人使用预染法时，，可依据染料类型选购威尼斯国际2299cc生物经典DNA Marker或LD系列DNA Marker。。。

如使用威尼斯国际2299cc生物DSRed或其他新型无毒核酸染料，，请搭配LD DNA Marker;

如使用EB或Goldview类核酸染料，，请搭配经典DNA Marker。。。

特殊提醒，，市场上核酸染料名称繁杂，，质量狼籍不齐，，不可强求所有染料染色的Marker都有优异效果哦~